在延安整风期间，有人曾问博古“是否反毛（泽东）”。博古回答，他心里有两条底线：一是朱毛是红军的缔造者，他们是革命的旗帜；二是共产国际曾要求他团结毛泽东，所以他不反毛泽东。

博古1931年9月上台不久就接到苏区中央局来电，他们要开苏维埃政府成立大会，要求派一个工人出身的苏维埃政府主席来主持会议。博古召开中央政治局会议，决定设苏维埃政府主席为毛泽东，副主席为张国焘与项英。项英是工人出身，且曾被斯大林接见过，而张国焘是建党元老之一。从中可以看出博古对毛泽东的尊重。

1932年11月，米夫（时任共产国际驻中国代表团团长）曾给斯大林及中共中央写信，认为中国红军有力量进攻一两个中心城市。中共中央和苏区中央局都认同这个意见。苏区中央局大部分同志赞同在赣江周围找中心城市，集中力量攻取，以便把各分散的苏区连成一片。毛泽东则主张沿福建、江西、湖南边界上的三山建立苏区。以王稼祥为一方的其他苏区中央领导人认为毛泽东“右倾”，主张让毛泽东离开军队专做政府工作。上海临时中央和共产国际远东局都表示，反对让毛泽东离开军队。现在有些文章把攻打赣州、把毛泽东离开红军说成是博古中央造成的，这是没有任何根据的。

1934年1月，中共召开六届五中全会，博古被选为党中央总书记。毛泽东因准备第二次苏维埃代表大会的报告，未出席这次会议。在缺席的情况下，大会仍把毛泽东选为政治局委员，这为毛泽东遵义会议后成为政治局常委作了铺垫。1934年10月长征前，中央接到毛泽东来信，要求在苏区打游击。博古与周恩来商议后，决定劝毛泽东一起长征，并接受他的要求，将中央机关、军委机关和中央政府机关单独编队。

1935年1月遵义会议后，博古从总书记位置上撤下来，但他还是4个政治局常委之一。随后他与其他3个常委分别赞同毛泽东为常委，赞同新成立由毛泽东参与的新的领导军队的3人小组。

与四方面军会合后，博古赞同毛泽东北上方针，坚决驳斥张国焘的分裂行为。共产国际解散后，国民党趁延安整风之际，也叫嚣要中国共产党解散。博古当时处境不好，整风检查尚未过关，但他随即发表《在毛泽东旗帜下，为保卫中国共产党而战斗》的署名文章，批驳了所谓“共产国际解散后，共产党内部必将分裂”的胡言。博古旗帜鲜明地说：“22年来中国共产党从来没有像今天在毛泽东同志领导下这般坚固亲密……决非任何造谣能伤害其毫发的。”

这些史实足以说明：博古对毛泽东相当尊重。即便退居政治局常委，在党中央和毛泽东的领导下，博古仍干了许多大事。当然，在他担任党中央总负责人期间，在贯彻共产国际指示和工作中二人难免有不同意见，有争论，但这不能认为是反毛泽东。特别是当时党处于早年，博古、王稼祥等人也都很年轻，加之当时中国共产党是共产国际的一个支部，他们的主要问题是没有按照中国国情来执行共产国际的指示。