一种适合于PCR扩增的真菌基因组DNA提取方法
2011-05-02李晓倩
山东农业大学学报(自然科学版) 2011年1期
关键词:植物
李晓倩
(泰山医学院生物科学系,山东 泰安 271016)
药用真菌和药用植物内生真菌作为重要的微生物资源,近年来在抗肿瘤、抗菌、抗病毒[1-2]等方面发挥着越来越重要的作用,现已被广泛应用于生物医药、食品及生物防治等领域。真菌的鉴定工作是真菌资源开发的关键环节。目前,真菌的鉴定仍以形态鉴定为主,但有一些药用真菌形态特征不易辨认或者不易产生子实体,有的药用植物内生真菌在人工培养基中不产孢,这给真菌的分类鉴定工作带来了很大的困难。随着分子生物学技术的不断发展,提取真菌的基因组DNA进行分子鉴定已成为真菌分类鉴定的一种重要方式。核糖体DNA上的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)是存在于18S rDNA、5.8S rDNA和28S rDNA之间的区域,该区域受外界环境因素的影响较小,与编码区域相比具有进化速度快的特点,在种内的不同菌株之间高度保守,而在真菌种间存在极大的变化,表现出极大的序列多态性,可以为真菌学的研究提供丰富的遗传信息[3],已广泛用于药用真菌如冬虫夏草[4]、金耳[5]等的系统发育以及不产孢植物内生真菌[6-7]的分类鉴定等研究。
优化简便易行的真菌高质量基因组DNA提取方法将会对真菌鉴定工作提供便利。高质量DNA要求高纯度、无蛋白、糖类、酚类、盐类等杂质污染,高分子量、无降解和有一定的数量。药用真菌和药用植物内生真菌的细胞壁都含有复杂的多糖物质、色素以及成分不明的粘稠胞壁物质,这些物质的存在常导致制备的基因组DNA样品中带有不同数量的多糖和其它成分,影响基因组DNA样品的限制性酶切、连接以及PCR反应等操作。……
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