三峡工程建设历经17年，终告一段落。但工程建成后，并非一劳永逸，库区仍面临诸多疑难待解。

一是人多地少的基础性矛盾在库区显得非常突出。其次是关于产业振兴。三是生态环境的压力。

库区水土流失也堪忧。据记者获悉的重庆水利局一份资料称，“库区工农业生产、移民迁建工程和大量的开发建设活动，剧烈地扰动地表”。据2005年遥感调查显示，重庆三峡库区现有水土流失面积23870.16km2，占土地总面积的51.71%，是我国水土流失最严重的地区之一。

另一个就是地质安全的防治。重庆大学教授，三峡问题专家雷亨顺称，“三峡地区因造山运动形成，历来地质环境脆弱，它的岩石并非整体而是破碎的，像一个有着完好皮肤的人，但内部却是粉碎性骨折。