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广西眼镜蛇蛇毒的蛋白质组学研究

2022-07-27罗莹黄智李亚兰廖明

世界最新医学信息文摘 2022年12期
关键词:冻干粉蛇毒眼镜蛇

罗莹,黄智,李亚兰,廖明

(广西医科大学,广西 南宁 530021)

0 引言

广西地处亚热带,气候与自然环境都非常适合蛇类生存,毒蛇的种类繁多。近年来,随着城市绿化生态的还原以及人工养蛇业和食蛇餐饮业的发展,广西的蛇伤病例居高不下,每年约有3~4万人被蛇咬伤[1]。仅据本校附属医院急诊科统计2006-2015年十年的数据显示,平均每年收治的蛇伤患者近100例[2]。可见,广西长期以来是蛇伤的重点区域,蛇伤的临床诊断和治疗已成为广西医疗卫生行业的突出问题。

眼镜蛇咬伤是我国南方最常见的蛇伤之一,位居毒蛇咬伤发病率的第二位[3],而在广西则位于毒蛇咬伤的首位[4]。眼镜蛇的蛇毒为混合毒且组成成分十分复杂,造成眼镜蛇咬伤后的病理生理具有多样性,临床特征往往体现为伤口肿胀、溃烂坏死,呼吸困难、心力衰竭等等,严重者出现休克甚至死亡。目前,由于缺乏对广西眼镜蛇蛇毒所有成分的了解,给治疗带来了不少的困难,因此有必要详细对广西眼镜蛇蛇毒的蛋白质组进行研究,旨在为广西眼镜蛇的蛇伤诊治提供基础数据。

1 材料与方法

1.1 主要试剂与仪器

CCK-8试剂盒购于中国MCE。甲酸、乙腈购 于 德 国Merck公 司;DTT、IAA buffer、Trypsin buffer、 NH4HCO3均购于美国Sigma公司。广西眼镜蛇蛇毒冻干粉从广西医科大学蛇毒研究所获得。AB Triple TOF 5600/6600质 谱 仪(美 国AB SCIEX公司);1290 Infinity LC超高压液相色谱仪(安捷伦科技有限公司)。

1.2 蛇毒的定量和SDS-PAGE检测

取蛇毒冻干粉适量,溶解于高纯水,CCK-8试剂盒测蛇毒蛋白质的含量。12% SDS-PAGE对蛇毒蛋白质的质量进行分析。

1.3 蛇毒的FASP酶解

取蛇毒冻干粉适量,溶解于高纯水。然后取30µl溶解好的蛇毒溶液,加DTT达浓度为100mM,100℃5min,室温下冷却。接着加入200µLUA缓冲液混匀,经30kD超膜过滤,15min离心(14000g),弃滤液(重复以上步骤1次)。加入100µLIAA缓冲液,1min振荡(600rpm),室温下 反 应30min(避 光),14000g离 心15min。加入100µLUAbuffer离心14000g15min,重复2次。加 入100µL25mMNH4HCO3溶 液,14000g离 心15min,重复该步骤两次。加入40µLTrypsin缓冲液,振荡1min(600rpm),37℃放置16-18h,14000g离心15min,收集滤液。肽段用C18Cartridge脱盐,然后冻干,接着40µL0.1%CH2O2复溶,OD280进行定量。

1.4 LC-MS质谱分析

取1 µl酶解后产物进行LC-MS/MS分析(纳升级系统Easy nLC,)每个样品进样一次。采分离过程:A 液:0.1%甲酸,B 液:0.1%甲酸乙腈 (乙腈为84%)。95% A 液平衡色谱柱。样品上样到色谱柱Thermo scientific EASY column分离,流速:300 nL/min。相关设置: 2小时梯度: 0 min- 110 min, B液从0%-55%;110 min- 115 min, B液从55%-100%;115 min- 120 min, B液维持在100%。质谱仪质谱分析条件:正离子; 300-1800 m/z母离子扫描;一级质谱70,000 at m/z 200 分辨率;每次全扫描后采集20个碎片图谱进行二级质谱分析(分辨率:17,500 at m/z 200)。

1.5 质谱数据分析

原始文件(raw file)采用分析软件PD-Mascot查库进行数据库检索。蛋白数据库为uniprot_Naja_981_20201030.fasta。(http://www.uniprot.org)。其中搜库参数设定: Enzyme为Trypsin;Missed cleavage sites 设为2;固定修饰为Carbamidomethyl (C);动态修饰设定Oxidation (M);过滤参数为FDR≤0.01。

2 结果与分析

2.1 SDS-PAGE分析结果

考染结果见图1,蛇毒样品条带分离清晰,质量满足质谱鉴定的实验要求。

图1 广西眼镜蛇蛇毒SDS-PAGE电泳考染分析图

2.2 LC-MS/MS鉴定广西眼镜蛇蛇毒蛋白质结果

质谱共鉴定到了59个蛋白,包括19大类的蛋白质:酸性磷脂酶A2,蛇毒神经生长因子,细胞毒素,神经毒素,金属蛋白酶,蛇毒磷酸二酯酶,磷脂酶A2受体抑制蛋白,富含半胱氨酸蛇毒蛋白,蛇毒5核苷酸酶,氨基酸氧化酶,Thaicobrin蛋白,磷脂酶A2,Nakoroxin蛋白,蛇毒抗菌肽,补体因子,丝氨酸蛋白酶抑制子,SH3结构域结合蛋白4,E3泛素蛋白连接酶,Envoplakin蛋白等。详细见表1。质谱分析的蛇毒蛋白质Basepeak图谱见图2。

图2 蛋白质Basepeak图谱

表1 LC-MS/MS鉴定广西眼镜蛇蛇毒蛋白列表

续表1

3 讨论

广西属于全国毒蛇咬伤高发区,每年的致死率和伤残率居高不下,成为突出的公共卫生问题。相关资料显示,广西常见毒蛇咬伤中,六成以上是眼镜蛇伤。蛇毒的生理和病理活性主要与其含有的蛋白质或肽段有关,因蛋白质组学技术在复杂体系中检测低丰度蛋白质的方面具备优势[5-7],可以通过蛋白质组学技术全面分析蛇毒的蛋白组成。最近几年相继有学者对中国境内的蝮蛇、蛇岛蝮、莽山洛铁头蛇等蛇毒[8-10]蛇毒蛋白组学研究。在中华眼镜蛇蛇毒中蛋白质组的研究中,Shan(2017)等人采用质谱技术鉴定到5类蛋白质家族共32个蛋白质[11],张经硕(2019)等人从筛选到11类蛋白质家族共17个蛋白质[12]。目前,由于缺乏对广西眼镜蛇蛇毒具体蛋白质成分的了解,本研究采用液质联用的串联质谱LC-MS/MS对广西眼镜蛇蛇毒的蛋白质组进行研究,质谱共鉴定出19类的蛋白质家族,共59个蛋白;分析发现细胞毒素类家族蛋白占了13个,为最多;接着是神经毒素家族类为10个和酸性磷酸酶家族类为6个。本实验获得的广西眼镜蛇蛇毒蛋白质的组成,将为蛇毒蛋白纯度的检测、表征和应用提供了可靠依据,可为蛇毒蛋白组分的纯化、药效、结构与功能等研究提供重要的信息,也同时为广西眼镜蛇的蛇伤诊治提供基础数据。

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