元朝的煤炭税，只在北京和大同征收。也是自元代开始，北京采煤几乎都集中在西山门头沟一带，当时曾出现过封建官府征工开采的煤窑，也有寺院经营的煤窑。至明代，门头沟的煤炭专供朝廷，并将宛平县丞移至门头沟，管理煤炭事宜。由于煤炭利润颇高，牵连过诸多朝廷官员，“赵高指鹿为马，忠贤以煤为矿”，这也成为魏忠贤的死罪之一。

在北京的煤炭产地中，明清的三大煤产地，门头沟煤炭称为红煤，房山沱称为黑煤，周口店称为南山煤。到了明代中期以后，门头沟一带开始出现民间采煤业，而且为数众多的民窑，大大超过了当时的官窑。从那时开始，门头沟所产的煤，也就成了供应北京地区民间用煤的主要来源地之一。根据朱彝尊的《日下旧闻》记载，门头沟附近村民“皆市石炭为生”，可见当时的民间采煤业已相当发达。

明清两代的封建官府设有专管西山煤矿的太监，他们主要是管为数不多的官窑，对于民窑，他们除趁机大肆勒索诈取煤税之外，至于如何开采，则不闻不问。在明万历年间，曾因民窑业主拖欠税款，明朝官府派京营军队以武裝催索矿款，激怒了民窑业主，联合了采煤工人、运煤脚夫等劳动者，进京向明朝官府请愿示威。《神宗实录》曾有一段记载，是日“激变窑民，填街塞路，持揭呼冤”。事件发生以后，迫使明朝政府不得不撤换了那个原来的主管太监。清乾隆年间，和家奴因为开采煤矿，影响京西寺庙水源，竟被乾隆下令诛杀。

清光绪年间为了煤炭运输，专门拟建从卢沟桥至门头沟的京西铁路。在铁路修成前，老北京运煤主要靠动物驮拉。其中骆驼性情温顺，步履迟缓行走如牛，但其负重力强，每天能载三四百公斤的货物，又耐饥渴，日行四五十公里不用饮水喂料，是运输煤炭、石灰、山货等的主要运输工具。

旧时，门头沟有很多小煤窑，当时没有大路，煤无法直接运出，于是骆驼就成了这一地区特有的运输工具。当时饲养骆驼的“驼户”多数集中在京西三家店、军庄、大峪、龙泉雾等村。骆驼从13世纪建成元大都城起，同北京人共生活了八百多年，到解放初期才逐渐走进了动物园。