APP下载

鱼腥藻铁调蛋白基因(alr0957)表达和Fe3+对藻生长的影响

2014-08-06陈思礼龚凤娇

关键词:质粒叶绿素克隆

陈思礼,龚凤娇,田 申

(中南民族大学 生命科学学院, 武汉 430074)

在鱼腥藻PCC7120中,铁元素的代谢途径由基因fur(furric uptake regulator)编码的铁吸收调节蛋白Fur调控.PCC7120基因组中有3种同源Fur基因,分别编码3种蛋白:FurA, FurB和FurC. FurC不与启动子结合,而是通过影响前两种蛋白与DNA靶位点结合的能力[1],从转录水平调节与铁代谢相关基因的表达[2].Fur是典型的负调控因子.当亚铁离子富足时,为避免过量金属对细胞产生毒性,Fur与亚铁离子结合成聚合物,占据调控区域,阻遏该基因表达;当亚铁离子贫乏时,未结合到亚铁离子的Fur蛋白不能顺利结合到DNA调控序列,则相关的基因表达开启.此外,Fur还对异形胞分化,转录调节和氧化还原平衡等功能相关的基因有重叠调控作用[3],还能抵御氧化胁迫和其它环境胁迫[4].

此次研究克隆出鱼腥藻PCC7120FurC基因(alr0957),成功构建表达载体pET-fur,并在大肠杆菌BL21中表达出了带有组氨酸标签的融合蛋白,并通过设计不同Fe3+浓度梯度,探讨不同铁离子浓度对藻类生长的影响,为进一步该蛋白研究奠定了基础.

1 材料与方法

1.1 藻种和细菌菌株

鱼腥藻Anabaenasp.PCC 7120购于中科院水生生物研究所淡水藻种库(FACHB).大肠杆菌DH5α、BL21(DE3)均为本实验室保藏菌种.

1.2 载体质粒及其他试剂

pET-28a(+)载体为本实验室构建并保存,pMD18-T载体(Takara公司),DNA聚合酶(Fermentas公司),限制性内切酶、T4 DNA连接酶(Takara公司),琼脂糖凝胶回收试剂盒、质粒DNA提取试剂盒(Axygene公司), PCR引物合成和基因序列测定由南京金斯瑞生物科技有限公司完成.

1.3 基因组DNA提取

PCC7120基因组DNA提取对传统酚氯仿作了改进.离心收集对数期藻细胞,无菌水清洗1次,重悬于100 mmol/L EDTA(pH 8.0),80 μL 50 mg/mL溶菌酶至终浓度2 mg/mL,37 ℃水浴约37 min,置于-20 ℃冰柜冷藏约30 min,反复数次直至溶液呈蓝绿色.加入SDS至终浓度1.5%,60 ℃水浴10 min至溶液变黄以充分裂解.再利用酚氯仿法对DNA进一步分离纯化.严格按照分子生物学标准方法进行操作[5].

1.4 引物设计与基因克隆

为便于克隆,在引物F1:5′-CGGGATCCTATGCAGCAACAGGCAATATC-3′和R1:5′-CCCAAGCTTCTACTCTTCATCTTGAGGATGC-3′中分别添加BamH I和Hind III酶切位点.PCR反应体系中含2.5μL 10×Taq buffer,引物各1μL,1μL dNTPs,2μL模板DNA,1μL DNA聚合酶,ddH2O补足到25 μL.PCR反应程序如下: 95 ℃预变性5 min; 95 ℃变性40 s,65 ℃~50 ℃复性40 s(每循环下降0.5 ℃),72 ℃延伸1 min,30个循环;95 ℃变性40 s, 50 ℃退火40 s,72℃延伸1 min, 15个循环;72 ℃延伸10 min.DNA凝胶回收层析柱纯化回收目的片段.与载体pMD18-T连接过夜,转化E.coliDH5α,转化子涂布于含氨苄青霉素LB平板上,并用蓝白斑筛选阳性克隆.经菌液PCR、质粒提取、双酶切等初步鉴定,送测序通过序列比对得以确定.

1.5 重组表达载体的构建

测序正确后,分别对pMD18-T-fur、pET-28a(+)提质粒,并由双酶切、回收目的片段在T4 DNA连接酶的作用下连接,转化到E.coliBL21感受态细胞中,涂布于卡那抗性LB平板上,筛选阳性克隆,送测序以确定.

1.6 重组蛋白的体外表达

将含pET-fur的重组菌BL21接种于含50 μg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37℃摇床培养约3 h至OD600≈0.5,加入1 mmol/L的IPTG于37℃下摇床培养18 h,诱导目的蛋白表达.离心收集沉淀,加入2×SDS凝胶缓冲液和还原性保护剂β-巯基乙醇,沸水浴5 min,离心取上清,用SDS-PAGE电泳检测外源蛋白质的分子量.

1.7 蛋白的纯化

用镍柱层析纯化pET系列载体表达产物.IPTG诱导后离心收集菌体,用Binding Buffer(BB)溶解,超声裂解30 min后离心去除杂质,取上清,离心后得包涵体.用含尿素的BB洗包涵体,将上清溶解液上柱,平衡柱子后进行柱层析,分管收集,每管2 mL.

1.8 Fe3+对鱼腥藻生长的影响

1.8.1 藻生长密度的测定

配制200 mL培养基,每个浓度设3个平行样品(配方略).接种10 mL对数期Anabaenasp.PCC 7120藻培养液至培养基中,使初始浓度在OD730≈0.5.接种好的藻液在25℃光照培养箱中静置培养,设置培养箱光照强度为2000 lux、光暗比为14 h︰10 h,每日轻轻震荡数次,从次日起,每天同一时间测定OD730,观察其生长情况.以生理盐水为参比溶液,测定鱼腥藻Anabaenasp.PCC 7120生长曲线.每个浓度的测量最终值取3个平行样品的均值.

1.8.2 叶绿素含量的测定

取10 mL藻细胞培养液,用0.45μm微孔滤膜抽滤,转移藻细胞至研钵中,加入6 mL 90%乙醇溶液,冰上充分研磨,将研磨液转入刻度试管中,4 ℃静置12 h进行暗反应, 4000 r/min离心15 min;转移上清至10 mL试管,向沉淀中加4 mL 90 %乙醇,静置1h后再4000 r/min离心15 min,合并两次提取的上清.以90 %乙醇作参比,在波长664 nm下测吸光度值,取每组平均值.计算叶绿素含量的公式为[6]:叶绿素浓度(mg/L)=(OD664×1000)/34.5。

1.8.3 蒽酮比色法测定总糖含量

制作葡萄糖标准曲线,620 nm比色得到葡萄糖标准曲线的公式(y=1.0093x-0.0177,y为蒽酮比色法测得的OD620,如表1).离心管收集培养至第7天的藻液,4 ℃ 9000 r/min离心10 min,弃上清,加入0.5 mol/L、pH 6.8的Tris-HCl缓冲液3 mL悬浮洗涤沉淀,4 ℃ 9000 r/min离心5 min,重复一次.菌体重悬于5 mL预冷的超声破碎细胞缓冲液中充分破碎细胞,取1 mL细胞破碎液,加4 mL蒽酮试剂混合均匀,沸水中煮沸10 min,取出后流水冷却,室温放置10 min,使之显色稳定,620 nm比色.根据测得OD620值,由葡萄糖标准曲线的公式计算藻的糖含量.

表1 葡萄糖标准溶液稀释梯度

2 结果

2.1 FurC(alr0957)基因的克隆

用touchdown PCR的方法从鱼腥藻Anabaenasp.PCC 7120基因组DNA中成功扩增得到450 bp的目的片段,如图1所示.将目的片段连接到pMD18-T载体上,再进行转化和重组子筛选.经鉴定测序,证明成功克隆了FurC基因.通过序列分析比对,可知该基因含有450 bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,其相对分子量为17380.

M:DNA Marker 2000;1~3) PCR产物图1 PCR扩增产物电泳图Fig.1 Electrophoresis identification of PCR product

2.2 重组表达载体pET-Fur的构建与鉴定

pMD-Fur经过BamH I/Hind III双酶切后,与pET-28a(+)相连接,转化表达菌株BL21,筛选阳性表达质粒.通过PCR、酶切初步鉴定均成阳性.经测序与NCBI公布的序列完全一致,说明成功构建了pET-Fur. IPTG对其在体外进行诱导表达.

2.3 融合蛋白的表达检测及纯化

样品经超声破碎并离心后,分别对上清和沉淀作SDS-PAGE电泳检测,结果表明:表达出的蛋白可溶性较低,大部分存在于离心后的沉淀部分,因为目的蛋白位于破碎的细胞膜上或产生了包涵体,在上清中浓度很低.FurC含17328个氨基酸,由于pET-FurC所表达的融合蛋白其N端带有T7-tag的11个氨基酸残基序列MASMTGGQQMG和1个多聚组氨酸标签,故预测该融合蛋白大小约为19 kD.如图2所示,融合蛋白pET-Fur获得了成功表达.经过一系列蛋白表达条件的优化,基本满足蛋白纯化的条件,利用镍柱层析法纯化FurC.

M:蛋白质分子量标准;1) 普通菌株BL21;2) 含pET-28 a (+)空载体的BL21;3) 未诱导的重组质粒pET-Fur;4) 经0.5 mmol/L IPTG诱导的重组质粒;5) 经1 mmol/L IPTG诱导的重组质粒图2 重组蛋白pET-Fur的SDS-PAGE检测 Fig.2 The SDS-PAGE assay of expressed pET-Fur

2.4 Fe3+对鱼腥藻生长的影响

通过设计不同Fe3+浓度对鱼腥藻PCC7120的生长影响实验,研究藻细胞在生长过程中叶绿素和可溶性糖含量的变化,结果见图3.图3a中不同浓度的Fe3+影响下,PCC7120生长速率有较明显差异.在0.1 ~0.5 mg/L时低浓度Fe3+对鱼腥藻PCC 7120的生长有较明显的促进作用,藻的生长在第3天出现转折点,斜率增加进入对数期,且Fe3+浓度越高,藻的生长状况越好,0.5 mg/L浓度为适合生长浓度.当Fe3+浓度大于0.9 mg/L时,随浓度的升高,藻的生长速率逐渐减慢,生长量减少;当Fe3+浓度为4.0 mg/L时,藻的生长率与低浓度Fe3+藻培养液相比,生长速率明显低于后者,甚至低于缺铁组,7d后生长量依然最低,故高浓度的铁对其生长有明显的抑制作用.

a~c)不同Fe3+浓度下PCC 7120生长曲线、叶绿素a含量和可溶性糖含量图3 不同Fe3+浓度下鱼腥藻Anabaena sp. PCC 7120生长指标的变化 Fig.3 Growth index changes in Anabaena sp.PCC 7120 treated with different concentrations of Fe3+

图3b中,当Fe3+浓度小于 0.5 mg/L,随Fe3+浓度的增加,叶绿素含量递增;但当Fe3+浓度大于0.9 mg/L时,铁离子对叶绿素a的合成受到了高浓度铁的胁迫作用,此时叶绿素a含量随着Fe3+浓度的增大而减少,与藻培养液颜色变化一致. 图3c中, Fe3+浓度梯度对糖含量影响与生长趋势和叶绿素a含量的变化非常类似.由于Fe是糖分解、合成代谢途径中的功能蛋白(如异柠檬酸脱氢酶)的重要组分,故糖含量在低Fe3+时随其浓度升高而增加,一旦超出需要的范围,则糖合成代谢被抑制,表现为随Fe3+浓度增加而递减.

3 讨论

目前证实在E.coli中,Fur基因控制90多种铁依赖性基因的表达,包括降解/合成铁载体的有关的酶类、铁载体受体、调控蛋白、膜载体、金属还原酶等基因[7].而Fur蛋白调节细胞内铁的生理代谢过程.

本文成功地将鱼腥藻PCC7120的alr0957(FurC)基因克隆并构建到表达载体pET-28a(+)上得到重组质粒pET-Fur,在37℃下经1 mmol/L诱导18 h,成功表达了融合蛋白,表达产物的SDS-PAGE电泳检测图与预期一致,大小约19 KD.通过优化表达条件实现了FurC蛋白的纯化,为FurC基因的功能进一步研究奠定了基础.

铁是藻类生长代谢的必需元素,但铁浓度过高又会导致藻细胞渗透性增加,甚至引起藻类形态的变异[8].不同Fe3+浓度影响鱼腥藻Anabaenasp. PCC7120的生长,其生长量和生长速率、叶绿素a含量、可溶性糖含量随Fe3+浓度变化先增后减,说明低浓度铁对藻的生长起促进作用,而超过一定浓度(本实验为0.9 mg/L)则为抑制作用.故治理藻类污染时,除了要注意控制氮、磷等大量元素外,还要考虑铁等微量元素的调控作用.

参 考 文 献

[1] Hernández J A, López-Gomollón S, Bes M T, et al. Three fur homologues from Anabaena sp. PCC7120: exploring reciprocal protein-promoter recognition[J]. FEMS Microbiol Lett, 2004, 236(2):275-282.

[2] 李俊峰.有益菌A18菌株铁载体的研究和铁吸收调节蛋白(Fur)基因的克隆和表达[D].青岛:中国海洋大学, 2005.

[3] López-Gomollón S, Hernóndez J A, Pellicer S, et al. Cross-talk between iron and nitrogen regulatory networks in anabaena(Nostoc)sp.PCC 7120: identification of overlapping genes in FurA and NtcA regulons[J]. J Mol Biol, 2007,3741(1):267-281.

[5] 萨姆布鲁克J, 拉塞尔D W.分子克隆实验指南精编版[M].黄培堂,王恒木梁,周晓巍,等译.北京:化学工业出版社,2007.

[6] 张丽彬, 王启山, 徐新惠, 等.乙醇法测定浮游植物叶绿素a含量的讨论[J].中国环境监测, 2008, 24(6):9-10.

[7] Hantke K. Members of the Fur protein family regulate iron and zinc transport inE.coliand characteristics of the Fur-regulated fhuF protein [J]. J Mol Microbiol Biotechnol, 2002, 4(3):217-222.

[8] 刘晓海, 高云涛, 杜 刚, 等.铁离子对滇池藻类生长的影响[J].环境污染与防治, 2006, 28(5):324-326.

猜你喜欢

质粒叶绿素克隆
克隆狼
农杆菌转化法中的“Ti质粒转化载体系统”的简介
——一道江苏高考题的奥秘解读和拓展
全基因组测序后质粒的组装与鉴定研究进展*
mcr-1阳性类噬菌体质粒与F33∶A-∶B-质粒共整合形成的融合质粒的生物学特性分析
浙江:诞生首批体细胞克隆猪
提取叶绿素
开发新方法追踪植物病害的全球传播(2020.6.7 iPlants)
锌对白菜和香葱叶绿素含量的影响研究
桃树叶绿素含量与SPAD值呈极显著正相关
属于“我们”